Sonja Schimmler ist in verschiedene Drittmittelprojekte involviert: Sie engagiert sich in der NFDI-Initiative (Nationalen Forschungsdateninfrastruktur) als Sprecherin des Konsortiums NFDI4DataScience und als Co-Sprecherin der Sektion Common Infrastructures, der Initiative Base4NFDI und des Konsortiums NFDI4Cat. Auch ist sie in der BUA (Berlin University Alliance) aktiv, als Verantwortliche für das Projekt »A Digital Research Space for the BUA« und am Weizenbaum-Institut als Leiterin der Forschungsgruppe »Digitalisierung und Öffnung der Wissenschaft«.

In ihrer Forschung konzentriert sie sich auf die Digitalisierung und Öffnung der Wissenschaft. Einen besonderen Schwerpunkt legt sie auf Forschungsdateninfrastrukturen. Ihre Forschungsinteressen reichen von Semantic Web und Linked Data über Data Science und Artificial Intelligence bis hin zu Software Engineering und Human-Centered Computing.

Sie hat Informatik an der Technischen Universität München und am Georgia Institute of Technology (USA) studiert und wurde an der Universität der Bundeswehr München promoviert.